Clannad, berceritakan tentang seorang laki-laki yang keluarganya kacau balau. Ibunya dia tinggal bersama ayahnya disebuah rumah sederhana. Kehidupan antara anak dan ayahnya sama sekali tidak akur, hal ini dikarenakan sang ayah yang akhir-akhir ini sering minum alkohol. Laki-laki itu bernama “Okazaki Tomoyo” yang bersekolah di salah satu SMA.
Suatu hari, ketika ia berangkat kesekolah, dia bertemu dengan seorang perempuan yang berdiri di tengah-tengah bukit menuju sekolah, yang bernama “Nagisa Furukawa”. Dia berada ditahun yang sama dengan okazaki, namun seharusnya saat ini dia sudah lulus. Dikarenakan penyakit misterius yang dideritanya, dimana pada saat musim dingin tiba, ia mengalami demam yang tak kunjung sembuh, bahkan sampai berbulan-bulan. Maka dari itu dia harus tinggal kelas karena jumlah kehadirannya di sekolah tidak cukup.
Setelah mereka berdua bertemu, kehidupan Okazaki pun berubah, begitu juga dengan Nagisa. Yang sebelumnya Okazaki adalah seorang pemalas, sekarang dia sudah melakukan hal yang cukup bermanfaat untuk mengisi waktu luangnya. Nagisa, yang sangat ingin bergabung dengan ektra drama, harus mengalami kekecewaan, karena ekstra drama saat itu sudah dibubarkan dikarenakan anggotanya yang tidak cukup. Karena tekad yang ia miliki, Nagisa ingin mendirikan ektra drama tersebut. Mulai dari sinilah, Nagisa mendapatkan banyak teman, begitu juga dengan Okazaki.
Waktu demi waktu berlalu, kejadian-kejadian luar biasa sering sekali terjadi. Mulai dari yang menyenangkan, hingga yang menyedihkan.
Dan
untuk season yang kedua, “Clannad After Story”. Disini Okazaki dan Nagisa
nantinya akan menikah (maaf spoiler). Okazaki yang setelah lulus bekerja
dirumahnya Nagisa untuk menjaga, toko, sedangkan Nagisa yang terpaksa harus
mengulangi 1 tahun lagi karena sakitnya. Setelah beberapa bulan, Okazaki
berhenti bekerja di rumah Nagisa, dan pindah pekerjaan sebagai tukang service
yang bekerja bersama dengan Yoshino
Setelah
lulus, Nagisa dan Okazaki memutuskan untuk menikah, meskipun baru saja lulus
SMA. Setelah mereka menikah, hal-hal yang menyenangkan mulai terjadi, mereka
berdua tampak menikmati hidup bersama. Namun disela-sela kehidupan mereka yang
bahagia itu, selalu datang rintangan-rintangan, salah satunya yaitu ayah Okazaki
yang tertangkap polisi. Hal ini benar-benar membuat Okazaki putus asa, namun
karena Nagisa ada disampingnya ia bisa menahan dirinya.